Sobre o Projeto
O BCM-HGSC está sequenciando o genoma do sooty mangabey (Cercocebus atys). Este projeto é uma colaboração com o Dr. Guido Silvestri (Universidade Emory).
Sooty mangabey
Image source: Yerkes NPRC
BCM-HGSC produziu um rascunho inicial de alta qualidade do genoma sooty mangabey usando a plataforma de sequenciamento Illumina. Além disso, o BCM-HGSC gerou aproximadamente 7x a cobertura total do genoma usando a plataforma Pacific Biosciences RS, e estas leituras longas serão usadas para preencher lacunas e melhorar a continuidade da montagem inicial.
Sooty mangabeys são um modelo animal importante para pesquisas relacionadas ao vírus da imunodeficiência humana (HIV) e AIDS. Os mangabeys sooty são os hospedeiros naturais de um vírus de imunodeficiência símia (SIV), e o HIV-2 é derivado desse SIV, provavelmente como resultado da transferência de espécies cruzadas do SIV. Os mangabeys não exibem patologia clínica ou outros efeitos adversos da infecção com sua SIV nativa, e assim o estudo da interação hospedeiro-vírus neste modelo animal é importante para a compreensão dos mecanismos pelos quais os mangabeys são capazes de controlar a infecção e evitar doenças.
O BCM-HGSC está gerando uma montagem de rascunho de alta qualidade para este genoma usando DNA de um mangabey fuliginoso obtido do Centro Nacional de Pesquisa de Primatas Yerkes da Universidade Emory. Além disso, o BCM-HGSC irá produzir uma cobertura completa da sequência do genoma para vários outros mangabey de fuligem não relacionados, a fim de identificar a variação genética dentro da espécie.
Acesso aos Dados
Todas as leituras de sequência são depositadas no arquivo de leitura de sequência NCBI.